RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC5A6Q9Y289 635 aa29.89■■■□□ 2.38
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EPPINO95925 133 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ME2P23368 584 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACVR2AP27037 513 aa29.88■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF148Q8N7C7 305 aa29.86■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SMPDL3BQ92485 455 aa29.86■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IL11P20809 199 aa29.84■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf185Q5T7R7 199 aa29.84■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa29.83■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM185BQ9H7F4 350 aa29.83■■■□□ 2.37
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN15P56746 228 aa29.82■■■□□ 2.36
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R1Q9NYW7 299 aa29.82■■■□□ 2.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa29.82■■■□□ 2.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 GJE1A6NN92 205 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 H0YC42 278 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGT1P19440 569 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCALDP61601 193 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRF1Q16656 503 aa29.81■■■□□ 2.36
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