RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	YPEL5	P62699	121 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	RNF44	Q7L0R7	432 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OR51A7	Q8NH64	312 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SMPDL3B	Q92485	455 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	C4orf36	Q96KX1	117 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	RASD1	Q9Y272	281 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		17.02	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559		J3QLW9	94 aa		17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF19	P17023	458 aa		17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	THBS2	P35442	1172 aa		17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	GZMK	P49863	264 aa		17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SLC3A1	Q07837	685 aa		17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		17.01	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0J9YY10	115 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SC5D	O75845	299 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35E2	P0CK97	266 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CRMP1	Q14194	572 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CA13	Q8N1Q1	262 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	GRHL3	Q8TE85	626 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	DOK4	Q8TEW6	326 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	POT1	Q9NUX5	634 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SCN2A	Q99250	2005 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GWA3	101 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559		E9PI62	339 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R3D	O95685	299 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF85	Q03923	595 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	MAB21L1	Q13394	359 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	TNK1	Q13470	666 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	17	■□□□□ 0.31	4e-6	■■■□□ 15.4
RRN3-205	ENST00000563559	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		17	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OR10H2	O60403	315 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CT62	P0C5K7	136 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	IL9	P15248	144 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	RAB38	P57729	211 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ACTA2	P62736	377 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ACTG2	P63267	376 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	E2F1	Q01094	437 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	EFR3A	Q14156	821 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	GPR176	Q14439	515 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ALG11	Q2TAA5	492 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	CDH23	Q9H251	3354 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	HR	O43593	1189 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	AKT2	P31751	481 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PYCR1	P32322	319 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	OR12D2	P58182	307 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	PLAUR	Q03405	335 aa		16.99	■□□□□ 0.31
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	16.99	■□□□□ 0.31

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