RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 PSME2Q9UL46 239 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PRB8 838 aa8.33□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 C2orf72A6NCS6 295 aa8.33□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 AQP12BA6NM10 295 aa8.33□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.33□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 HCRTR2O43614 444 aa8.33□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 FLOT2Q14254 428 aa8.33□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.33□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 MED12Q93074 2177 aa8.33□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.33□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF583Q96ND8 569 aa8.33□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.33□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 NGBQ9NPG2 151 aa8.33□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 CLIC1O00299 241 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 PDPK1O15530 556 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 TCF21O43680 179 aa8.32□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 HBA1P69905 142 aa8.32□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 OR52E8Q6IFG1 317 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 FAM166AQ6J272 317 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ADAM5Q6NVV9 412 aa8.32□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 STK32CQ86UX6 486 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD46Q86W74 232 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 CLECL1Q8IZS7 167 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.32□□□□□ -1.08
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