RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 PDZK1Q5T2W1 519 aa21.17■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 P2RY8Q86VZ1 359 aa21.17■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 ZNF524Q96C55 264 aa21.17■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 COQ8BQ96D53 544 aa21.17■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 APOPT1Q96IL0 206 aa21.17■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 MECRQ9BV79 373 aa21.17■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 GRIP2Q9C0E4 1043 aa21.17■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.17■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 SERINC1Q9NRX5 453 aa21.17■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 ZNF724A8MTY0 619 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 C9JVG2 144 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 CD5LO43866 347 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 ADAM11O75078 769 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 THBS1P07996 1170 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 C6orf136Q5SQH8 315 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 TIMM23BQ5SRD1 257 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 IL23RQ5VWK5 629 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 GALNT5Q7Z7M9 940 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 ZNF100Q8IYN0 542 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 FNDC5Q8NAU1 212 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 OR5D16Q8NGK9 328 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 OR5AK3PQ8NH89 298 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 OR2W6PQ8NHA6 318 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 SDF2Q99470 211 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 LAT2Q9GZY6 243 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 MKS1Q9NXB0 559 aa21.16■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 SERINC4A6NH21 518 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 DUXAA6NLW8 204 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 ESPNB1AK53 854 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 RAMP1O60894 148 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 CYP7B1O75881 506 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 H6PDO95479 791 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 CD8AP01732 235 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 GGT1P19440 569 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 PRPS1L1P21108 318 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 SOAT1P35610 550 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 CDH11P55287 796 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 C21orf58P58505 322 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 GPR68Q15743 365 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 NRF1Q16656 503 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 HMBOX1Q6NT76 420 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 DNM1P46Q6ZS02 220 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 DTX2Q86UW9 622 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 TMEM234Q8WY98 164 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 ST8SIA1Q92185 356 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 RADILQ96JH8 1075 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 DUSP26Q9BV47 211 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 YAE1D1Q9NRH1 226 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PBX1-217ENST00000559578 SHISA9B4DS77 424 aa21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 ABCD4O14678 606 aa21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 NDUFS7O75251 213 aa21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 AK1P00568 194 aa21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 IFNA2P01563 188 aa21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 COX5AP20674 150 aa21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 IGHV1-2P23083 117 aa21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 DIO1P49895 249 aa21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 SKP2Q13309 424 aa21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 C3orf30Q96M34 536 aa21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 EMC3Q9P0I2 261 aa21.14■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 SULT2B1O00204 365 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 SPAG7O75391 227 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 STX11O75558 287 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 CSTAP01040 98 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 SERPINB5P36952 375 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 RPS26P62854 115 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 HBA1P69905 142 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 MERTKQ12866 999 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 ZNF141Q15928 474 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 AGAP6Q5VW22 663 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 PODNL1Q6PEZ8 512 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 TMPPEQ6ZT21 453 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 HIPK1Q86Z02 1210 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 RHNO1Q9BSD3 238 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 NPAP1Q9NZP6 1156 aa21.13■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 OR5H1A6NKK0 313 aa21.12■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 SSX4O60224 188 aa21.12■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 DNAJA2O60884 412 aa21.12■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 PGM3O95394 542 aa21.12■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 PGCP20142 388 aa21.12■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 MATN1P21941 496 aa21.12■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 EDNRAP25101 427 aa21.12■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 SESN3P58005 492 aa21.12■□□□□ 0.97
PBX1-217ENST00000559578 SYT14P1Q58G82 188 aa21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms