RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558687.1

SNHG21-203, Transcript of small nucleolar RNA host gene 21, human

TSL 4

Gene SNHG21, Length 558 nt, Biotype antisense RNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG21-203	ENST00000558687	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	TMEM114	B3SHH9	223 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	SULT2B1	O00204	365 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	RAD51D	O75771	328 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	UBL4A	P11441	157 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	COX5A	P20674	150 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	CD40	P25942	277 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	HPCAL1	P37235	193 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	PDLIM4	P50479	330 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	MLC1	Q15049	377 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	KIAA0040	Q15053	153 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	QPRT	Q15274	297 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	DCST2	Q5T1A1	773 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	CDC73	Q6P1J9	531 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	NATD1	Q8N6N6	113 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	CCDC63	Q8NA47	563 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	INPP5K	Q9BT40	448 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	CHODL	Q9H9P2	273 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687		A0A096LNT2	108 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	NDUFS8	O00217	210 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	GLRA3	O75311	464 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	CYP7B1	O75881	506 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	ABHD2	P08910	425 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	TFPI	P10646	304 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	MAPK1	P28482	360 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	CCT5	P48643	541 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	DIO1	P49895	249 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	PDK3	Q15120	406 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	ZNF385B	Q569K4	471 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	ST8SIA1	Q92185	356 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	HTRA1	Q92743	480 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	MOAP1	Q96BY2	351 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	TRMO	Q9BU70	441 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	CUBN	O60494	3623 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	AZIN1	O14977	448 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	SDC1	P18827	310 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	PGC	P20142	388 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	DNAJB13	P59910	316 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	TGFBR3	Q03167	851 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	MERTK	Q12866	999 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	PDE7A	Q13946	482 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	MNS1	Q8NEH6	495 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	PIGX	Q8TBF5	258 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	UPB1	Q9UBR1	384 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG21-203	ENST00000558687	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53	1e-7	■■■■□ 21.6
SNHG21-203	ENST00000558687	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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