RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	QPRT	Q15274	297 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SERPINA11	Q86U17	422 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	KRT73	Q86Y46	540 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	POC1B	Q8TC44	478 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC58	Q96CX6	371 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ACER3	Q9NUN7	267 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF175	Q9Y473	711 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TACC2	O95359	2948 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CDHR4	A6H8M9	788 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CLCA1	A8K7I4	914 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549		H3BML4	177 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MRAS	O14807	208 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ADAMDEC1	O15204	470 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	OIP5	O43482	229 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GMFG	O60234	142 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RCBTB2	O95199	551 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CRH	P06850	196 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NUDT7	P0C024	238 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	FCGR2A	P12318	317 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	BMP5	P22003	454 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	HTR3A	P46098	478 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CCR4	P51679	360 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF136	P52737	540 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	FOXF1	Q12946	379 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SELENBP1	Q13228	472 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	OR2A2	Q6IF42	318 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF550	Q7Z398	422 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SNX32	Q86XE0	403 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	HIPK4	Q8NE63	616 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RNF145	Q96MT1	663 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF607	Q96SK3	696 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	DVL2	O14641	736 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	SERPINB7	O75635	380 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	CYP7B1	O75881	506 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	KRT34	O76011	436 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	CTSS	P25774	331 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	PRDX6	P30041	224 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	SSTR2	P30874	369 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	PRKAR1B	P31321	381 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	OPRM1	P35372	400 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	CLDN15	P56746	228 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	SESN3	P58005	492 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	TLE4	Q04727	773 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	FOXF2	Q12947	444 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	SCARB2	Q14108	478 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	ADRM1	Q16186	407 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	REP15	Q6BDI9	236 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	GRINA	Q7Z429	371 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	GGN	Q86UU5	652 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	LILRA2	Q8N149	483 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	FBXO27	Q8NI29	283 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	MAL2	Q969L2	176 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	C14orf79	Q96F83	325 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM23-231	ENST00000557549	ADGRG7	Q96K78	797 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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