RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	NID1	P14543	1247 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PGC	P20142	388 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ME2	P23368	584 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ARFIP2	P53365	341 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CRISP3	P54108	245 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SIRPA	P78324	504 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	FADD	Q13158	208 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	GUSBP1	Q15486	140 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	HBM	Q6B0K9	141 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	LUZP2	Q86TE4	346 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ST8SIA1	Q92185	356 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	OSTF1	Q92882	214 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	STARD4	Q96DR4	205 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ACER3	Q9NUN7	267 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1W2PNR3	127 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	FBP2	O00757	339 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ARAF	P10398	606 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	IL7R	P16871	459 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CARD18	P57730	90 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP10-9	P60411	292 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	MERTK	Q12866	999 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SELENBP1	Q13228	472 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SELPLG	Q14242	412 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	OR2A2	Q6IF42	318 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CMIP	Q8IY22	773 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	DPP10	Q8N608	796 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	NFKBID	Q8NI38	313 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF563	Q8TA94	476 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PMM1	Q92871	262 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SAR1A	Q9NR31	198 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CALML5	Q9NZT1	146 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	GMEB1	Q9Y692	573 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TACC2	O95359	2948 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0G2JPF8	293 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CDHR4	A6H8M9	788 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ANGPT2	O15123	496 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PGM3	O95394	542 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	SYNGR4	O95473	234 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CGA	P01215	116 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CRH	P06850	196 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	GKN3P	P0CG01	181 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	FCGR2A	P12318	317 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PRG2	P13727	222 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	GPX2	P18283	190 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	KLK2	P20151	261 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	EPS8	Q12929	822 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ADRM1	Q16186	407 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	LIN52	Q52LA3	116 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	C10orf82	Q8WW14	230 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM234	Q8WY98	164 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	C14orf79	Q96F83	325 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	CGREF1	Q99674	301 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TPCN1-223	ENST00000552985	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8

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