RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 PGCP20142 388 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 CRYGSP22914 178 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 DNASE1P24855 282 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 AGTR1P30556 359 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 SFTPDP35247 375 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 CPOXP36551 454 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 CDKN2CP42773 168 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 MVDP53602 400 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 NME5P56597 212 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 SESN3P58005 492 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 KCNJ10P78508 379 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 TIGD2Q4W5G0 525 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 C3orf33Q6P1S2 294 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 PAMR1Q6UXH9 720 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 BEND4Q6ZU67 534 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 RNF130Q86XS8 419 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 OR52B2Q96RD2 323 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 INPP5KQ9BT40 448 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 SRXN1Q9BYN0 137 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 KLHL13Q9P2N7 655 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 PRR14LQ5THK1 2151 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 A0A1W2PPR1 153 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 FAAHO00519 579 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 RFXANKO14593 260 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 UBDO15205 165 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 SIAH2O43255 324 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 PRKD3O94806 890 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 ATE1O95260 518 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 H6PDO95479 791 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 KRT75O95678 551 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 C1QCP02747 245 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 RAF1P04049 648 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 KCNJ5P48544 419 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 MAP2K6P52564 334 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 CASP9P55211 416 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 PLAURQ03405 335 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 CHRNEQ04844 493 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 NXNQ6DKJ4 435 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 STAC2Q6ZMT1 411 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 FCRLAQ7L513 359 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 OLIG3Q7RTU3 272 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 STK32CQ86UX6 486 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 ROBO4Q8WZ75 1007 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 MED18Q9BUE0 208 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 CCDC106Q9BWC9 280 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 RMND5AQ9H871 391 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 BCO1Q9HAY6 547 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 SERINC1Q9NRX5 453 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 ARID1AO14497 2285 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 FAM234BA2RU67 622 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 C9JVG2 144 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 DNPH1O43598 174 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 CYTIPO60759 359 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 GSNP06396 782 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 YES1P07947 543 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 CHRM4P08173 479 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 SLC7A1P30825 629 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 HTR3AP46098 478 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 CCR4P51679 360 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 HPCAP84074 193 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 PDK3Q15120 406 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 MAPK11Q15759 364 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 SYPL1Q16563 259 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 ZSWIM7Q19AV6 140 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 GPAT3Q53EU6 434 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 SYT14P1Q58G82 188 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 COX20Q5RI15 118 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 TMEM201Q5SNT2 666 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 FBXW10Q5XX13 1052 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 TFAP2EQ6VUC0 442 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 TMPPEQ6ZT21 453 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 C22orf34Q6ZV56 151 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 GRINAQ7Z429 371 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 GABRG1Q8N1C3 465 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 MIER2Q8N344 545 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 ANKFN1Q8N957 763 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 RFWD2Q8NHY2 731 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-223ENST00000551137 ABHD3Q8WU67 409 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms