RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 NIPAL3Q6P499 406 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ASB9Q96DX5 294 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DIRC2Q96SL1 478 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 GNG8Q9UK08 70 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 H3BNX3 289 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 HRO43593 1189 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 AIFM1O95831 613 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 GBAP04062 536 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 POU2F1P14859 743 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 HTR1EP28566 365 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 HTR5AP47898 357 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 KANK2Q63ZY3 851 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RETREG3Q86VR2 466 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NT5CQ8TCD5 201 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 AGAP11Q8TF27 550 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 S1PR5Q9H228 398 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TPST2O60704 377 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV3-25P01717 112 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ITGB8P26012 769 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CCR2P41597 374 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MC2RQ01718 297 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CLN3Q13286 438 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FITM2Q8N6M3 262 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PWWP2AQ96N64 755 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 JAM3Q9BX67 310 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SATB2Q9UPW6 733 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SUSD5O60279 629 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MT-CO2P00403 227 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PCGF2P35227 344 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF81P51508 661 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NEDD8Q15843 81 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DDI2Q5TDH0 399 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LIPNQ5VXI9 398 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TPRA1Q86W33 373 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR5W2Q8NH69 310 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 KCTD7Q96MP8 289 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SPIN2AQ99865 258 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ING4Q9UNL4 249 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1W2PQ09 198 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SYT7O43581 403 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PYDC2Q56P42 97 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLC48A1Q6P1K1 146 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM239Q8WW34 195 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM63Q969Q1 353 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CLDN23Q96B33 292 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MKLN1Q9UL63 735 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NFS1Q9Y697 457 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 A0A087WV62 115 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLC1A7O00341 560 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ADAM23O75077 832 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 WDR1O75083 606 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 EPHA1P21709 976 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 IMPA1P29218 277 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms