RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV3-27P01718 113 aa7.95□□□□□ -1.14
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF695Q8IW36 515 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 GTF2H4Q92759 462 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.94□□□□□ -1.14
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