RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545346.1

QKI-216, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, humanhuman

TSL 5

Gene QKI, Length 457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QKI-216ENST00000545346 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 OR2L5Q8NG80 312 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 OR4E2Q8NGC2 313 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 SELENOMQ8WWX9 145 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 SMIM10Q96HG1 83 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 HARBI1Q96MB7 349 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 IL17FQ96PD4 163 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 ZPBPQ9BS86 351 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 DPH7Q9BTV6 452 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 TBCDQ9BTW9 1192 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 MS4A8Q9BY19 250 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 NLNQ9BYT8 704 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 HRH4Q9H3N8 390 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 LYRM4Q9HD34 91 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 MYNNQ9NPC7 610 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 SAR1AQ9NR31 198 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 GIMAP4Q9NUV9 329 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 AIG1Q9NVV5 245 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 SPHK1Q9NYA1 384 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 CEP250Q9BV73 2442 aa3.55□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 A0A0A6YYD5 115 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 A0A1W2PP11 408 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 GSAPA4D1B5 854 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 LRIT2A6NDA9 550 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 TMEM8BA6NDV4 472 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 MAGEB17A8MXT2 336 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 H0YIG0 161 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 SLC30A4O14863 429 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 HAT1O14929 419 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 ANKRD28O15084 1053 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 UBDO15205 165 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 NDUFS4O43181 175 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 CTSVO60911 334 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 SDC3O75056 442 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 ATP5HO75947 161 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 WISP2O76076 250 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 MYO1DO94832 1006 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 NSA2O95478 260 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 CLDN14O95500 239 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 PDYNP01213 254 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 IL6P05231 212 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 HBQ1P09105 142 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 FGF5P12034 268 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 CEACAM1P13688 526 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 PRPS1L1P21108 318 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 CDH3P22223 829 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 PSMB5P28074 263 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 PPP2R1BP30154 601 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 RORAP35398 523 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 FRKP42685 505 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 CCR10P46092 362 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 HTR6P50406 440 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 FOXA1P55317 472 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 CLDN8P56748 225 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 CLDN20P56880 219 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 STX1BP61266 288 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 RUNX1T1Q06455 604 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 ZNF763Q0D2J5 394 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 PDE7AQ13946 482 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 RCAN2Q14206 197 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 ABRAXAS2Q15018 415 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 NDUFA9Q16795 377 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 IMPG1Q17R60 797 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 SYT16Q17RD7 645 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 C18orf63Q68DL7 685 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 CLEC6AQ6EIG7 209 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 PRMT9Q6P2P2 845 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 WDR73Q6P4I2 378 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 GUSBP11Q6P575 273 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 TRIM40Q6P9F5 258 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 ABHD13Q7L211 337 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 COMMD6Q7Z4G1 85 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 VN1R4Q7Z5H5 301 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 ASPGQ86U10 573 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 NUDT13Q86X67 352 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 RIMKLAQ8IXN7 391 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 EID2Q8N6I1 236 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.54□□□□□ -1.84
QKI-216ENST00000545346 PPFIBP2Q8ND30 876 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms