RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG6-201ENST00000520348 PNMTP11086 282 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 CEACAM1P13688 526 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 MAKP20794 623 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 F8A1P23610 371 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 PTGDSP41222 190 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG6-201ENST00000520348 GIPRP48546 466 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG6-201ENST00000520348 CDH15P55291 814 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG6-201ENST00000520348 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG6-201ENST00000520348 ZNF524Q96C55 264 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG6-201ENST00000520348 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG6-201ENST00000520348 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG6-201ENST00000520348 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG6-201ENST00000520348 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG6-201ENST00000520348 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
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SNHG6-201ENST00000520348 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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SNHG6-201ENST00000520348 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 HHATLQ9HCP6 504 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNHG6-201ENST00000520348 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNHG6-201ENST00000520348 HCRTR2O43614 444 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PTP4A3O75365 173 aa14.63□□□□□ -0.07
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SNHG6-201ENST00000520348 PGCP20142 388 aa14.63□□□□□ -0.07
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SNHG6-201ENST00000520348 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.62□□□□□ -0.07
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SNHG6-201ENST00000520348 ENO4A6NNW6 628 aa14.62□□□□□ -0.07
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