RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 FBXW5Q969U6 566 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ARL8AQ96BM9 186 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 OR5B2Q96R09 309 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 POTEKPQ9BYX7 375 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 LAT2Q9GZY6 243 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 MKLN1Q9UL63 735 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 DPRXA6NFQ7 191 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 OVOL3O00110 214 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CYTIPO60759 359 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 DNAJA2O60884 412 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 UGT2B17O75795 530 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 LYZL6O75951 148 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 AK1P00568 194 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CASP9P55211 416 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 SESN3P58005 492 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 BSPH1Q075Z2 132 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ST8SIA1Q92185 356 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ITM2AO43736 263 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 TYROBPO43914 113 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CSTAP01040 98 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CDKN1AP38936 164 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ETV4P43268 484 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 DIO1P49895 249 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 VSNL1P62760 191 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 VEZF1Q14119 521 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 STK11Q15831 433 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 OR4A15Q8NGL6 344 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 TMEM234Q8WY98 164 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 MDFIQ99750 246 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 OR51I1Q9H343 314 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ASIC5Q9NY37 505 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 LIPT1Q9Y234 373 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 HIVEP2P31629 2446 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PP18 115 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 WDR91A4D1P6 747 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZNF724A8MTY0 619 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 RNF223E7ERA6 249 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 FESP07332 822 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 OR12D1P0DN82 309 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 PGCP20142 388 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 MERTKQ12866 999 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 FAPQ12884 760 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 MAPK14Q16539 360 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 SMU1Q2TAY7 513 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 PGGHGQ32M88 737 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 TRIM2Q9C040 744 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 EXD2Q9NVH0 621 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 JMJD1CQ15652 2540 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZANQ9Y493 2812 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 SULT2B1O00204 365 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 RAMP1O60894 148 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 IGHV1-2P23083 117 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 IDUAP35475 653 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 PPA1Q15181 289 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 ETFDHQ16134 617 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-211ENST00000513325 SYT14P1Q58G82 188 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms