RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABHD3	Q8WU67	409 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	ST8SIA1	Q92185	356 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	VPS33A	Q96AX1	596 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZBTB18	Q99592	522 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACER3	Q9NUN7	267 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	PROCR	Q9UNN8	238 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGAP5	A6NIR3	686 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFXANK	O14593	260 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP7B1	O75881	506 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SASH3	O75995	380 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYNGR4	O95473	234 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	THBD	P07204	575 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ETFA	P13804	333 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	POU2F1	P14859	743 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENPP1	P22413	925 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNJ10	P78508	379 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	POU4F3	Q15319	338 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPAT3	Q53EU6	434 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF550	Q7Z398	422 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTF2H4	Q92759	462 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	NINJ1	Q92982	152 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIPT1	Q9Y234	373 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM234B	A2RU67	622 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP3D1	O14617	1153 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOSR1	O95249	250 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TGDS	O95455	350 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGC	P20142	388 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAC3	P60763	192 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	FCRLA	Q7L513	359 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MIER2	Q8N344	545 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLRX2	Q9NS18	164 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ROS1	P08922	2347 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTOR	P42345	2549 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GJE1	A6NN92	205 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	C16orf97	H3BN30	126 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATE1	O95260	518 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT75	O95678	551 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRYGS	P22914	178 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	EDNRA	P25101	427 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEA8	P43361	318 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ART1	P52961	327 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTBP2	P56545	445 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP2R2A	P63151	447 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MERTK	Q12866	999 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.31	□□□□□ -0.6

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