RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ETV1P50549 477 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 DCAF7P61962 342 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 CCL7P80098 99 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 MED22Q15528 200 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 NNATQ16517 81 aa9.91□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 RABEPKQ7Z6M1 372 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.91□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 SLC43A2Q8N370 569 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC15A4Q8N697 577 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OR14A16Q8NHC5 309 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC2A12Q8TD20 617 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 GRHL3Q8TE85 626 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PIGKQ92643 395 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ARSGQ96EG1 525 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 LMF1Q96S06 567 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 MND1Q9BWT6 205 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TEX12Q9BXU0 123 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 FN3KQ9H479 309 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR52Q9Y2T5 361 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A087WUJ7 227 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 YKT6O15498 198 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OIP5O43482 229 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 HCN1O60741 890 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 CH25HO95992 272 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHA1P01876 353 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 LIMS3P0CW19 117 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 LIMS4P0CW20 117 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PTNP21246 168 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 MTNR1AP48039 350 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR143P51810 404 aa9.9□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 ACY1Q03154 408 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ALG10BQ5I7T1 473 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf189Q5VU69 101 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 APOOLQ6UXV4 268 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 HSDL2Q6YN16 418 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 USP43Q70EL4 1123 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 MFSD4AQ8N468 514 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF614Q8N883 585 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 FANK1Q8TC84 345 aa9.9□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 CENPOQ9BU64 300 aa9.9□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 LRRN3Q9H3W5 708 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PALMDQ9NP74 551 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 LNP1A1A4G5 178 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 CPED1A4D0V7 1026 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 HTR3EA5X5Y0 456 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 CLDN25C9JDP6 229 aa9.89□□□□□ -0.83
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