RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 RABL3Q5HYI8 236 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 WBP2NLQ6ICG8 309 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MRGPRGQ86SM5 289 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CALHM3Q86XJ0 350 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 VRK2Q86Y07 508 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PTOV1Q86YD1 416 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TREML1Q86YW5 311 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ZZZ3Q8IYH5 903 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 LZICQ8WZA0 190 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC120Q96HB5 630 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL15Q96M94 604 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIB1Q96RU8 372 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PRRG4Q9BZD6 226 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 GLRX2Q9NS18 164 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 M0QX08 132 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 DVL2O14641 736 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 GSTA4O15217 222 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF208O43345 1280 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CD1EP15812 388 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CALB2P22676 271 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNA8P32881 189 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RYKP34925 604 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 STARP49675 285 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CARD18P57730 90 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 FOXF1Q12946 379 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 C5orf46Q6UWT4 87 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF836Q6ZNA1 936 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 OLIG3Q7RTU3 272 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 UBQLNLQ8IYU4 475 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP24Q8N264 748 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2V1Q8NHB1 315 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SMPDL3BQ92485 455 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PROX1Q92786 737 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 DDIT4LQ96D03 193 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 NSL1Q96IY1 281 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF583Q96ND8 569 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF559Q9BR84 538 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC39A3Q9BRY0 314 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM2Q9C040 744 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ALG2Q9H553 416 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 C12orf10Q9HB07 376 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ADPRHL2Q9NX46 363 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CHRNA9Q9UGM1 479 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 HRH3Q9Y5N1 445 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF407Q9C0G0 2248 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 B4DXG7 233 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC14L5O43304 696 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 DNPH1O43598 174 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 FMO6PO60774 539 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MFN2O95140 757 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 NTN1O95631 604 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 IL18BPO95998 194 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 GLI4P10075 376 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CXCR1P25024 350 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 OPRM1P35372 400 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PEX19P40855 299 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 GZMMP51124 257 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PSME3P61289 254 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 GTF3C1Q12789 2109 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SELPLGQ14242 412 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFAF6Q330K2 333 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 HBMQ6B0K9 141 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC15A3Q8IY34 581 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MICU2Q8IYU8 434 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PGAM4Q8N0Y7 254 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 LSMEM1Q8N8F7 131 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 POC1BQ8TC44 478 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBA1CQ9BQE3 449 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM27Q9HBJ8 222 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CHST11Q9NPF2 352 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM215AQ9Y5M1 114 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms