RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 MKS1Q9NXB0 559 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 RCE1Q9Y256 329 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 VAMP5O95183 116 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 CXCR5P32302 372 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 RAB35Q15286 201 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC25Q86WR0 208 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SLC35F6Q8N357 371 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 REEP4Q9H6H4 257 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1B0GUS0 222 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 FAM234BA2RU67 622 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 PDPK1O15530 556 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 EFNA2O43921 213 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ENTPD5O75356 428 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 FGF4P08620 206 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SSTR1P30872 391 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 PRPS1P60891 318 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 LGSNQ5TDP6 509 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 LILRA2Q8N149 483 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 COQ8BQ96D53 544 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 DOK1Q99704 481 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 DUXAA6NLW8 204 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 B4DSR2 109 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SCO2O43819 266 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 MAPK1P28482 360 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SLC35A1P78382 337 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF117Q03924 483 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SKP2Q13309 424 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM237Q96Q45 408 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 METRNQ9UJH8 293 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 DNAJC13O75165 2243 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ABCD4O14678 606 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SSX4O60224 188 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV3-15P01624 115 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 UROSP10746 265 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 PGCP20142 388 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 FOXF1Q12946 379 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 TRADDQ15628 312 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 NRN1LQ496H8 165 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 DESI1Q6ICB0 168 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 GRINAQ7Z429 371 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 RNF175Q8N4F7 328 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO27Q8NI29 283 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ESAMQ96AP7 390 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 APH1AQ96BI3 265 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 NTN4Q9HB63 628 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 MID2Q9UJV3 735 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ITGA5P08648 1049 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 CBR1P16152 277 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ITGA2P17301 1181 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 FXNQ16595 210 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 HAX1O00165 279 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF264O43296 627 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 KIAA0513O60268 411 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ADH4P08319 380 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 HKR1P10072 659 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 ANPEPP15144 967 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-210ENST00000503258 EGR1P18146 543 aa6.73□□□□□ -1.33
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