RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 PSD2Q9BQI7 771 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 EMC3Q9P0I2 261 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 DNPH1O43598 174 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 SPAG7O75391 227 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 AGR2O95994 175 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 LAMP1P11279 417 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 UBL4AP11441 157 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 GGT1P19440 569 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 COX5AP20674 150 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ALDH3A1P30838 453 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 C21orf58P58505 322 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 PGGHGQ32M88 737 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 KRT71Q3SY84 523 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 CROCCP2Q86T23 111 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 SDF2Q99470 211 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 LAT2Q9GZY6 243 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 DPRXA6NFQ7 191 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 SERINC4A6NH21 518 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANKRD28O15084 1053 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 TYROBPO43914 113 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 STX11O75558 287 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 PTAFRP25105 342 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 QPRTQ15274 297 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF141Q15928 474 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 SMU1Q2TAY7 513 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 XKR7Q5GH72 579 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZIM3Q96PE6 472 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 POLE3Q9NRF9 147 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 OR5H1A6NKK0 313 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPR171O14626 319 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 PIP5K1BO14986 540 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 PGCP20142 388 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ACER3Q9NUN7 267 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 EXD2Q9NVH0 621 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 SHISA9B4DS77 424 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 CFLARO15519 480 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 PEX11AO75192 247 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 C6orf47O95873 294 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 CD8AP01732 235 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 IGHV4-39P01824 125 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 BMP4P12644 408 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 ACVR1BP36896 505 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 CDKN1AP38936 164 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 ETV4P43268 484 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAP2K6P52564 334 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 SKP2Q13309 424 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 TSC22D1Q15714 1073 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 IL23RQ5VWK5 629 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF614Q8N883 585 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms