RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		15.51	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	FIG4	Q92562	907 aa		15.51	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10A4	Q9H209	315 aa		15.51	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		15.51	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		15.51	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		15.51	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		15.51	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		15.51	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3D21	A4FU49	640 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT34	O76011	436 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ETFA	P13804	333 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	DNASE1	P24855	282 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CRISP3	P54108	245 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	RGN	Q15493	299 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF141	Q15928	474 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	COX20	Q5RI15	118 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	MKLN1	Q9UL63	735 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	VDAC3	Q9Y277	283 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		15.5	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	MED12L	Q86YW9	2145 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC14L5	O43304	696 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	DCTN3	O75935	186 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNGR4	O95473	234 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	H6PD	O95479	791 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	NTN1	O95631	604 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP3CB	P16298	524 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	IST1	P53990	364 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF117	Q03924	483 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CD226	Q15762	336 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	GTDC1	Q4AE62	458 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX32	Q86XE0	403 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01560	Q8TB33	94 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CGREF1	Q99674	301 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	VAPA	Q9P0L0	249 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	GMEB1	Q9Y692	573 aa		15.49	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0G2JPF8	293 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YC42	278 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf97	H3BN30	126 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	MRAS	O14807	208 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0513	O60268	411 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	FCMR	O60667	390 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT14	O95848	222 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	HRG	P04196	525 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	NID1	P14543	1247 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ART1	P52961	327 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SYPL1	Q16563	259 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	VWA1	Q6PCB0	445 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	GATS	Q8NAP1	163 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5W2	Q8NH69	310 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10D3	Q8NH80	312 aa		15.48	■□□□□ 0.07
HDAC10-216	ENST00000489424	POC1B	Q8TC44	478 aa		15.48	■□□□□ 0.07

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