RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 SGTBQ96EQ0 304 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.831e-10■■■■■ 37.4
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP6V0BQ99437 205 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 NPAS2Q99743 824 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 EGFL8Q99944 293 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LXNQ9BS40 222 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 BEX2Q9BXY8 128 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ACPTQ9BZG2 426 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNK15Q9H427 330 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ELOVL6Q9H5J4 265 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ASB7Q9H672 318 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GLRX2Q9NS18 164 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 BFARQ9NZS9 450 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 KLHL21Q9UJP4 597 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DNPEPQ9ULA0 475 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PLCL2Q9UPR0 1127 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HSPB11Q9Y547 144 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 BCORQ6W2J9 1755 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TANC1Q9C0D5 1861 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ROBO3Q96MS0 1386 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LAMB2P55268 1798 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LRP5O75197 1615 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1B0GVY2 172 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM149AA5PLN7 773 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 KBTBD13C9JR72 458 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 L7N2F9 121 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SGK1O00141 431 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PDXKO00764 312 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC30A4O14863 429 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TXNL1O43396 289 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SGCEO43556 437 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PLIN3O60664 434 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PRAMEF11O60813 436 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HUS1O60921 280 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GLRA3O75311 464 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SEC22BO75396 215 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TADA2AO75478 443 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 UGT2B17O75795 530 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFAND5O76080 213 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RHOBTB1O94844 696 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PROSCO94903 275 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 NXPH2O95156 264 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 STARD3NLO95772 234 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 IFNB1P01574 187 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ALPPP05187 535 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HTR1AP08908 422 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 TCF4P15884 667 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PCMT1P22061 227 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CA6P23280 308 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MYL9P24844 172 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HLA-DMAP28067 261 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC6A6P31641 620 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GABRA5P31644 462 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SPAM1P38567 509 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PSMD8P48556 350 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HNMTP50135 292 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SERPINB9P50453 376 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB13P51153 203 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CLCN4P51793 760 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CAPZA1P52907 286 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 UGT2B15P54855 530 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNK10P57789 538 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DSCR10P59022 87 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SIRPAP78324 504 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RBP5P82980 135 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CNTN2Q02246 1040 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PUDPQ08623 228 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 C17orf67Q0P5P2 114 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 FADDQ13158 208 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SLAMF1Q13291 335 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PDK2Q15119 407 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC26Q2I0M4 334 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT39Q6A163 491 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms