RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 MPP4Q96JB8 637 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 DSN1Q9H410 356 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 KLRF1Q9NZS2 232 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 SELENONQ9NZV5 590 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 DXOO77932 396 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 NUDT14O95848 222 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ELK4P28324 431 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 SLC6A8P48029 635 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 P2RX1P51575 399 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 CD47Q08722 323 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 TSPAN31Q12999 210 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 MEP1AQ16819 746 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 H3F3CQ6NXT2 135 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF786Q8N393 782 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 HS6ST2Q96MM7 605 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ING2Q9H160 280 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 METTL7AQ9H8H3 244 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ENOPH1Q9UHY7 261 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 MED31Q9Y3C7 131 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 DOCK10Q96BY6 2186 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 H3BN98 237 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 CDC42EP2O14613 210 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 KLF4O43474 513 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 IL5RAQ01344 420 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 C17orf67Q0P5P2 114 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 COL28A1Q2UY09 1125 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 VASH2Q86V25 355 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 KIF18BQ86Y91 864 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 MISPQ8IVT2 679 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 PSMF1Q92530 271 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 HRH3Q9Y5N1 445 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 A0A087WUJ7 227 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 LIPCP11150 499 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 IFI30P13284 250 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 MAKP20794 623 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 GGT2P36268 569 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 CASP3P42574 277 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 PRKCDQ05655 676 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM156Q8N614 296 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ASPMQ8IZT6 3477 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 EML6Q6ZMW3 1958 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 WISP1O95388 367 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 FUT1P19526 365 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 GSTM3P21266 225 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 FPR3P25089 353 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 SLC1A3P43003 542 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 CBFBQ13951 182 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 DCAF10Q5QP82 559 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 APOL4Q9BPW4 351 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 DPH1Q9BZG8 443 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 EGLN3Q9H6Z9 239 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 MED11Q9P086 117 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ZAR1LA6NP61 321 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 RBM34P42696 430 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 LAIR2Q6ISS4 152 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 GPR119Q8TDV5 335 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 BPIFA2Q96DR5 249 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 DCHS1Q96JQ0 3298 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 TP53I11O14683 189 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 TNFAIP8O95379 198 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 PGCP20142 388 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 RTP5Q14D33 572 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 PRAMEF20Q5VT98 475 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 SETD9Q8NE22 299 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 CNIH3Q8TBE1 160 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ADAM19Q9H013 955 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 RASSF1Q9NS23 344 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ANKRD10Q9NXR5 420 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 TACR3P29371 465 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 RPS6KA3P51812 740 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ACER2Q5QJU3 275 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 FAM81AQ8TBF8 368 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 MYRFQ9Y2G1 1151 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 CDK5R2Q13319 367 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 QPRTQ15274 297 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ELOA3BQ3SY89 546 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM154Q6P9G4 183 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 ELOA3Q8NG57 546 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 FBLIM1Q8WUP2 373 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 HPF1Q9NWY4 346 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 WIF1Q9Y5W5 379 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-207ENST00000472863 TRABD2BA6NFA1 517 aa25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms