RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 GALK2Q01415 458 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PMP22Q01453 160 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SYPL1Q16563 259 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ARTNQ5T4W7 220 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MDGA2Q7Z553 956 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MAL2Q969L2 176 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ENKD1Q9H0I2 346 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MUC13Q9H3R2 512 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 NEK6Q9HC98 313 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 POLE3Q9NRF9 147 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 U3KQV3 271 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 DNAJC13O75165 2243 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 DHRS12A0PJE2 317 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MT-ND5P03915 603 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GKN3PP0CG01 181 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 NCK1P16333 377 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 P2RX1P51575 399 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SLC35A1P78382 337 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PCOLCEQ15113 449 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 KCNJ8Q15842 424 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ITPKCQ96DU7 683 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF347Q96SE7 839 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SORT1Q99523 831 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 NANOGQ9H9S0 305 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 A0A087WZY1 265 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CXCL13O43927 109 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CLDN15P56746 228 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 RHAGQ02094 409 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 AAED1Q7RTV5 226 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CAMKMTQ7Z624 323 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 LILRA2Q8N149 483 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 OR8J3Q8NGG0 315 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 OR5M1Q8NGP8 315 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 FAR1Q8WVX9 515 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TM9SF2Q99805 663 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 FMO6PO60774 539 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 UGT2B11O75310 529 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 RCBTB2O95199 551 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TRIP10Q15642 601 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SGCAQ16586 387 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MTX3Q5HYI7 312 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM205Q6UW68 189 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SPERTQ8NA61 448 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 OR2M7Q8NG81 312 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 OR5W2Q8NH69 310 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SGTBQ96EQ0 304 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 C12orf49Q9H741 205 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ABCG2Q9UNQ0 655 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1B0GTH9 108 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CLOCKO15516 846 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 KCNK2O95069 426 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 KDELR2P33947 212 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 PTGER4P35408 488 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GSK3BP49841 420 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ACTR3P61158 418 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TUBA3CQ13748 450 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM200AQ86VY9 491 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms