RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461327.5

RRM2-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-204	ENST00000461327	RNF145	Q96MT1	663 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2-204	ENST00000461327	VSTM2L	Q96N03	204 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2-204	ENST00000461327	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2-204	ENST00000461327	BBS4	Q96RK4	519 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2-204	ENST00000461327	CCT7	Q99832	543 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2-204	ENST00000461327	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2-204	ENST00000461327	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2-204	ENST00000461327	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2-204	ENST00000461327	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2-204	ENST00000461327		A0A087WV62	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TRIM77	I1YAP6	450 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TM9SF1	O15321	606 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PSMG1	O95456	288 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	CD40	P25942	277 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PDE7A	Q13946	482 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	CROCCP2	Q86T23	111 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SVOPL	Q8N434	492 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ADAMDEC1	O15204	470 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	RAD51D	O75771	328 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	BCKDHA	P12694	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GGT1	P19440	569 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	IGHV1-2	P23083	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GALNTL6	Q49A17	601 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	DEF8	Q6ZN54	512 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327		Q6ZT83	130 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ELP4	Q96EB1	424 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	RADIL	Q96JH8	1075 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TSSK3	Q96PN8	268 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	INPP5K	Q9BT40	448 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	CENPH	Q9H3R5	247 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	REEP4	Q9H6H4	257 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	STOML1	Q9UBI4	398 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	UPK1A	O00322	258 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	AKAP10	O43572	662 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PEX11A	O75192	247 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SLITRK5	O94991	958 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	IL33	O95760	270 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SERPINE1	P05121	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	IFI6	P09912	130 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	CDH15	P55291	814 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	CARD18	P57730	90 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	HILS1	P60008	231 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PSG6	Q00889	435 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	MLC1	Q15049	377 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TRIP10	Q15642	601 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	TMEM107	Q6UX40	140 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	OR2L13	Q8N349	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	GATS	Q8NAP1	163 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	SORT1	Q99523	831 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RRM2-204	ENST00000461327	OR5H1	A6NKK0	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms