RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460639.2

ATRX-204, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 3

Gene ATRX, Length 461 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-204ENST00000460639 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 LRRC75AQ8NAA5 344 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 PPFIBP2Q8ND30 876 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 PROKR2Q8NFJ6 384 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 FANK1Q8TC84 345 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 PPP4R1Q8TF05 950 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 NR4A3Q92570 626 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 OLFM3Q96PB7 478 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 IL4I1Q96RQ9 567 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 FMO2Q99518 471 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 COPS8Q99627 209 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 GPR174Q9BXC1 333 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 CSTL1Q9H114 145 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 RNF121Q9H920 327 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 EBF2Q9HAK2 575 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 MED17Q9NVC6 651 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 IL36AQ9UHA7 158 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 ZNF221Q9UK13 617 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 STAP1Q9ULZ2 295 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 STARD10Q9Y365 291 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 R4GN57 208 aa3.96□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 FRMPD4Q14CM0 1322 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SYNJ2O15056 1496 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 FAM74A7A6NL05 159 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SERPINE3A8MV23 424 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 INSIG1O15503 277 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 CLDN14O95500 239 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 IL6P05231 212 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 FCER2P06734 321 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 PRSS2P07478 247 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 HOXC6P09630 235 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SLC26A3P40879 764 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 MATKP42679 507 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 KCNJ3P48549 501 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 POU3F4P49335 361 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 THBS3P49746 956 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 RAP1GDS1P52306 607 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 PDX1P52945 283 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 CALCOCO2Q13137 446 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 GRB14Q14449 540 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 CCDC58Q4VC31 144 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 TP53I3Q53FA7 332 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 CD300LGQ6UXG3 332 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SSX9Q7RTT3 188 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 ACOT1Q86TX2 421 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 LIX1Q8N485 282 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 OR4F5Q8NH21 305 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 OR52E5Q8NH55 327 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 MYLPFQ96A32 169 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 RAD51AP1Q96B01 352 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 HAUS1Q96CS2 278 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 C4orf45Q96LM5 186 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 C17orf77Q96MU5 243 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 OR4F4Q96R69 305 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SLC29A1Q99808 456 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SLC6A7Q99884 636 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 PXMP2Q9NR77 195 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 CHRAC1Q9NRG0 131 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 GID8Q9NWU2 228 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 RNF186Q9NXI6 227 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 CYTH4Q9UIA0 394 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 IKZF3Q9UKT9 509 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 CACNG2Q9Y698 323 aa3.95□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 WDR7Q9Y4E6 1490 aa3.94□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa3.94□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 A0A1B0GVG6 124 aa3.94□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa3.94□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SNURFLB1AK76 121 aa3.94□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 CLOCKO15516 846 aa3.94□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SNAPINO95295 136 aa3.94□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 OXTP01178 125 aa3.94□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 IGHG4P01861 327 aa3.94□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 SLC35G4P0C7Q5 338 aa3.94□□□□□ -1.78
ATRX-204ENST00000460639 FAM157CP0CG43 387 aa3.94□□□□□ -1.78
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