RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449491.1

USP25-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 5

Gene USP25, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-205ENST00000449491 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 C8orf4Q9NR00 106 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PXMP2Q9NR77 195 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 MIS18AQ9NYP9 233 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ATP10DQ9P241 1426 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PAK5Q9P286 719 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 LRRC42Q9Y546 428 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 NPTNQ9Y639 398 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.4□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TRAV24A0A0B4J272 114 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 MGAT4DA6NG13 374 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 A8MU76 341 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SNURFLB1AK76 121 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 E7ESA3 106 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 M0R296 226 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CHEK1O14757 476 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SCGNO76038 276 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SERPINA6P08185 405 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 LHCGRP22888 699 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 FCARP24071 287 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 MMP12P39900 470 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CSNK1DP48730 415 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 NDST1P52848 882 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 LBX1P52954 281 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 KCNK10P57789 538 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PPIAP62937 165 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GLO1Q04760 184 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 IL10RBQ08334 325 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 NME3Q13232 169 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 NFATC2Q13469 925 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CDH18Q13634 790 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 VAMP3Q15836 100 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ZNF74Q16587 644 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PHKG1Q16816 387 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SBK1Q52WX2 424 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 LGSNQ5TDP6 509 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 RHBDD2Q6NTF9 364 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ASCL4Q6XD76 172 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 G2E3Q7L622 706 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ZNF440Q8IYI8 595 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 LIX1Q8N485 282 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TEX26Q8N6G2 289 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CCNYL1Q8N7R7 359 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SYT14Q8NB59 555 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 LHX4Q969G2 390 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 GLYATL1Q969I3 302 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 RAD51AP1Q96B01 352 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TMEM45BQ96B21 275 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PYCR2Q96C36 320 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 OTUB2Q96DC9 234 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TSSK2Q96PF2 358 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TSSK3Q96PN8 268 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 VGLL1Q99990 258 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 NAT9Q9BTE0 207 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PLLPQ9Y342 182 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TMED7Q9Y3B3 224 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PRSS21Q9Y6M0 314 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 R4GN57 208 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa3.39□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 ROCK1Q13464 1354 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SMARCA2P51531 1590 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 A0A0J9YWU9 116 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 C2CD4DB7Z1M9 353 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 F8VVB4 439 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 F8VWA3 439 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 DLGAP1O14490 977 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 CHUKO15111 745 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 LATO43561 262 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 SCO2O43819 266 aa3.38□□□□□ -1.87
USP25-205ENST00000449491 RPS6KA5O75582 802 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms