RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SYNGR4O95473 234 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ETFAP13804 333 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PGCP20142 388 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CRATP43155 626 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CARD18P57730 90 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 DSTNP60981 165 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SIRPAP78324 504 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNJ10P78508 379 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SQLEQ14534 574 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 BTLAQ7Z6A9 289 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 HMGN2P46Q86SG4 172 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CMIPQ8IY22 773 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM234Q8WY98 164 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 OSTF1Q92882 214 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SPDL1Q96EA4 605 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TIGARQ9NQ88 270 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ACER3Q9NUN7 267 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC167Q9P0B6 97 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 DSPPQ9NZW4 1301 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A096LPI6 279 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CLDN24A6NM45 220 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 NR5A2O00482 541 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PLGP00747 810 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CD8BP10966 210 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 NID1P14543 1247 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CD1EP15812 388 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CPOXP36551 454 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SESN3P58005 492 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PLAURQ03405 335 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 GNA13Q14344 377 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 MAPK11Q15759 364 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 C3orf33Q6P1S2 294 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM214BQ7L5A3 538 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM200AQ86VY9 491 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PEX5LQ8IYB4 626 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SIKE1Q9BRV8 207 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 RABEP2Q9H5N1 569 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 COQ10BQ9H8M1 238 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 NPHS2Q9NP85 383 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 GLRX2Q9NS18 164 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CALML5Q9NZT1 146 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 EMC9Q9Y3B6 208 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 AKAP6Q13023 2319 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 FBN3Q75N90 2809 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CLIC1O00299 241 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CTAG2O75638 210 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CGAP01215 116 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 BCHEP06276 602 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 DBIP07108 87 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TFPTP0C1Z6 253 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC7A1P30825 629 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PCYT1AP49585 367 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CRISP3P54108 245 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CTBP2P56545 445 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 MERTKQ12866 999 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 AGKQ53H12 422 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 LRIF1Q5T3J3 769 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 OR6K3Q8NGY3 331 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF563Q8TA94 476 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF128Q8TEB7 428 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC38A5Q8WUX1 472 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR60Q8WVS4 1066 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TMUB1Q9BVT8 246 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SRXN1Q9BYN0 137 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 RAD21L1Q9H4I0 556 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC52A3Q9NQ40 469 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 DCTN4Q9UJW0 460 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PROCRQ9UNN8 238 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM247A6NEH6 219 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 A6NNC1 897 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAM11O75078 769 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 EPXP11678 715 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 BMP2P12643 396 aa12.64□□□□□ -0.39
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