RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.27□□□□□ -0.6
NEK1-201ENST00000439128 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.27□□□□□ -0.6
NEK1-201ENST00000439128 ENPP4Q9Y6X5 453 aa11.27□□□□□ -0.6
NEK1-201ENST00000439128 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PAHP00439 452 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 GSTT2P0CG29 244 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ST6GAL1P15907 406 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZNF12P17014 697 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PIGFQ07326 219 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ENTPD8Q5MY95 495 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ARSKQ6UWY0 536 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 VASH2Q86V25 355 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 INTS14Q96SY0 518 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 LHX6Q9UPM6 363 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TAF1P21675 1872 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 LRRC30A6NM36 301 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 LMO7DNF2Z398 122 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PLOD2O00469 737 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 FBP2O00757 339 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 GPR171O14626 319 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 STSP08842 583 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 EFNA3P52797 238 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 FAM57BQ71RH2 274 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 DCDC2BA2VCK2 349 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TRAPPC2LH3BP13 241 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 M0R1B8 84 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 DSCR3O14972 297 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 RAB3AP20336 220 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ARL3P36405 182 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 GPR3P46089 330 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 LIM2P55344 173 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZXDAP98168 799 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PUDPQ08623 228 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MKXQ8IYA7 352 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZNF740Q8NDX6 193 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 IL17RDQ8NFM7 739 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 FCAMRQ8WWV6 532 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MED16Q9Y2X0 877 aa11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 A0A1W2PQ09 198 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 NKX6-3A6NJ46 265 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TBX10O75333 385 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 LHCGRP22888 699 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PGFP49763 221 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ATP6AP1Q15904 470 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 C6orf141Q5SZD1 244 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SLC6A19Q695T7 634 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 LMF1Q96S06 567 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CENPBD1B2RD01 187 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TARM1B6A8C7 271 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 G3V2L1 256 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SURF4O15260 269 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ATG12O94817 140 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SFTPBP07988 381 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 DPTQ07507 201 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SYPL1Q16563 259 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CCSMST1Q4G0I0 132 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ZFP41Q8N8Y5 198 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 NEIL3Q8TAT5 605 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 SLITRK5O94991 958 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 GGT1P19440 569 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MVKQ03426 396 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 C16orf58Q96GQ5 468 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 FUZQ9BT04 418 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MS4A8Q9BY19 250 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 EGLN1Q9GZT9 426 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 DCSTAMPQ9H295 470 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 HIF3AQ9Y2N7 669 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 CLDN25C9JDP6 229 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 ABHD16AO95870 558 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 EMP3P54852 163 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 GNB2P62879 340 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 BORCS5Q969J3 196 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TMEM45AQ9NWC5 275 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 MKS1Q9NXB0 559 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 AASSQ9UDR5 926 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.26□□□□□ -0.61
NEK1-201ENST00000439128 TP53I3Q53FA7 332 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms