RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	DUSP5	Q16690	384 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	GALNT10	Q86SR1	603 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	COQ8B	Q96D53	544 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	STAC	Q99469	402 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	BTBD2	Q9BX70	525 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	GIN1	Q9NXP7	522 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	KLF4	O43474	513 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	C1QC	P02747	245 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	PGR	P06401	933 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	THBD	P07204	575 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	KRT16	P08779	473 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	PAX1	P15863	534 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	ADH6	P28332	368 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	PPP2R2B	Q00005	443 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	MAPRE2	Q15555	327 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	ZAR1	Q86SH2	424 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	OSTF1	Q92882	214 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	SPDL1	Q96EA4	605 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	OR52E6	Q96RD3	313 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	NGB	Q9NPG2	151 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A0J9YW62	118 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC22A2	O15244	555 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	SCN2B	O60939	215 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	NUDT14	O95848	222 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	OPN1LW	P04000	364 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	AGTR1	P30556	359 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	HBA1	P69905	142 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKRD46	Q86W74	232 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF611	Q8N823	705 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	VPS33A	Q96AX1	596 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	PIGU	Q9H490	435 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	C12orf49	Q9H741	205 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	RMND5A	Q9H871	391 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	GP6	Q9HCN6	339 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	TRIM64B	A6NI03	449 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	HS3ST1	O14792	307 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	ANGPT2	O15123	496 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	KRT34	O76011	436 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	LINGO3	P0C6S8	592 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	SFTPD	P35247	375 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	SOAT1	P35610	550 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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