RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 NIPAL3Q6P499 406 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PXKQ7Z7A4 578 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CACUL1Q86Y37 369 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 THAP4Q8WY91 577 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ELP4Q96EB1 424 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 DDOQ99489 341 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ENKD1Q9H0I2 346 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 C20orf85Q9H1P6 137 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SYNPO2LQ9H987 977 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PRDM7Q9NQW5 492 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL28Q9NXS3 571 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PLPP2O43688 288 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ICAM2P13598 275 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SHHQ15465 462 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC48A1Q6P1K1 146 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ABHD17CQ6PCB6 329 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 TMIEQ8NEW7 156 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ST8SIA4Q92187 359 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0B4J203 849 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 REM1O75628 298 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB3BP20337 219 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 FXYD6P3P58550 94 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK3Q00526 305 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 DYRK1AQ13627 763 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 AGERQ15109 404 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 TCTE1Q5JU00 501 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MTFR2Q6P444 385 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 Q6ZTK2 550 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PRSS45Q7RTY3 260 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC16A11Q8NCK7 471 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4D9Q8NGE8 314 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SFXN2Q96NB2 322 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 DPH1Q9BZG8 443 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 EMC3Q9P0I2 261 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CES1P1Q9UKY3 287 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPM6Q9BX84 2022 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 TOR1AO14656 332 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PEX14O75381 377 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MT-ND5P03915 603 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 F3P13726 295 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKAR1BP31321 381 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 TUSC1Q2TAM9 212 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM35AQ53FP2 167 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OR6M1Q8NGM8 313 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC35A4Q96G79 324 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SHARPINQ9H0F6 387 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OR52D1Q9H346 318 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 FLVCR2Q9UPI3 526 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMK2AQ9UQM7 478 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SC5DO75845 299 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MPIP34949 423 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC16A1P53985 500 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 RPTNQ6XPR3 784 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 C3P1Q6ZMU1 363 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 C17orf47Q8NEP4 570 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 GANCQ8TET4 914 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MOAP1Q96BY2 351 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 GIMAP5Q96F15 307 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CHIAQ9BZP6 476 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ALDOBP05062 364 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ATF1P18846 271 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 P2RY2P41231 377 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ERVK-21P61565 698 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ZIC1Q15915 447 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 GAB4Q2WGN9 574 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ACSM3Q53FZ2 586 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM111BQ6SJ93 734 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms