RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.04□□□□□ -1.44
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CCL20-202ENST00000409189 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 COX11Q9Y6N1 276 aa6.04□□□□□ -1.44
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CCL20-202ENST00000409189 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.03□□□□□ -1.44
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CCL20-202ENST00000409189 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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CCL20-202ENST00000409189 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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CCL20-202ENST00000409189 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 TTC23Q5W5X9 447 aa6.03□□□□□ -1.44
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CCL20-202ENST00000409189 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.03□□□□□ -1.44
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CCL20-202ENST00000409189 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 OR51I1Q9H343 314 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 FANCEQ9HB96 536 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 PDE7BQ9NP56 450 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 EXD2Q9NVH0 621 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.03□□□□□ -1.44
CCL20-202ENST00000409189 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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CCL20-202ENST00000409189 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.02□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 GLOD5A6NK44 160 aa6.02□□□□□ -1.45
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CCL20-202ENST00000409189 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.02□□□□□ -1.45
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CCL20-202ENST00000409189 B4GALT2O60909 372 aa6.02□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 RDH16O75452 317 aa6.02□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 JRKO75564 520 aa6.02□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PGM3O95394 542 aa6.02□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 OPN1SWP03999 348 aa6.02□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
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