RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 NODALQ96S42 347 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF559Q9BR84 538 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 NUDT9Q9BW91 350 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM2Q9C040 744 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ADNPQ9H2P0 1102 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SCN3BQ9NY72 215 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 IL20Q9NYY1 176 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CTSFQ9UBX1 484 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 UNC13CQ8NB66 2214 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC88CQ9P219 2028 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PQD3 144 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 LNP1A1A4G5 178 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 HTR3EA5X5Y0 456 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SERINC4A6NH21 518 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SAGE2PA6NJ88 616 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CLCA1A8K7I4 914 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 B4E171 279 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ADAM10O14672 748 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 FLRT2O43155 660 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CHP2O43745 196 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TSPAN2O60636 221 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ALOX12BO75342 701 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SCRG1O75711 98 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CELA3BP08861 270 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 GKN3PP0CG01 181 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 PIPP12273 146 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TBXA2RP21731 343 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TSPAN7P41732 249 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 RBM34P42696 430 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 MASP1P48740 699 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 DAB2P98082 770 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 MVKQ03426 396 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 PRKCDQ05655 676 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 NSDHLQ15738 373 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf189Q5VU69 101 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 UBE2UQ5VVX9 321 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ACSM5Q6NUN0 579 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF550Q7Z398 422 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 GPR141Q7Z602 305 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 NRMQ8IXM6 262 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.52□□□□□ -1.53
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C6orf48-208ENST00000395788 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 OR4C3Q8NH37 302 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 OR8K3Q8NH51 312 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 PIGXQ8TBF5 258 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM255BQ8WV15 326 aa5.52□□□□□ -1.53
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C6orf48-208ENST00000395788 GGHQ92820 318 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 MPP4Q96JB8 637 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 LMF1Q96S06 567 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CTRCQ99895 268 aa5.52□□□□□ -1.53
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C6orf48-208ENST00000395788 OR8D2Q9GZM6 311 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 WDR54Q9H977 334 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 UBQLN4Q9NRR5 601 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 RASSF1Q9NS23 344 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 OCIAD1Q9NX40 245 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ERVK-18Q9QC07 812 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 AASSQ9UDR5 926 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 FER1L5A0AVI2 2057 aa5.52□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 COL6A3P12111 3177 aa5.52□□□□□ -1.53
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