RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 NRBP1Q9UHY1 535 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-540P-201ENST00000384622 ANGPT4Q9Y264 503 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-540P-201ENST00000384622 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-540P-201ENST00000384622 ACOT9Q9Y305 439 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-540P-201ENST00000384622 RNF115Q9Y4L5 304 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-540P-201ENST00000384622 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-540P-201ENST00000384622 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 DYSFO75923 2080 aa-1.47□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 BCORL1Q5H9F3 1711 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 TRGV2A0A075B6R0 118 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A0J9YXY3 114 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 MYBPHLA2RUH7 354 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 NKX6-3A6NJ46 265 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 RFPL4AA6NLU0 287 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 LRRC53A6NM62 1247 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 E7EWF7 191 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ARPC2O15144 300 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 TBX19O60806 448 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ENTPD6O75354 484 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 EEDO75530 441 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 CNMDO75829 334 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 TNFSF13O75888 250 aa-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 OR9G9P0C7N8 305 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 GLULP15104 373 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 CBR1P16152 277 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 AKR1C4P17516 323 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 TCN2P20062 427 aa-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 AK4P27144 223 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 PSMB8P28062 276 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 SERPINB3P29508 390 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 PPP2R1BP30154 601 aa-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 MSH2P43246 934 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 HSPA7P48741 367 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR1D5P58170 312 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF33AQ06730 810 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 KLC1Q07866 573 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 HTR4Q13639 388 aa-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ARMC12Q5T9G4 340 aa-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 FBXW9Q5XUX1 488 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ACSM5Q6NUN0 579 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 Q6ZRX8 168 aa-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 OR6Y1Q8NGX8 325 aa-1.48□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 GPR137Q96N19 417 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 IL4I1Q96RQ9 567 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 AMELYQ99218 206 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 PAFAH2Q99487 392 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 UGT2B28Q9BY64 529 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 SDCBP2Q9H190 292 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 CARD9Q9H257 536 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 C3orf14Q9HBI5 128 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 POLD4Q9HCU8 107 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 SH3GLB2Q9NR46 395 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 GKN1Q9NS71 199 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 TERF2IPQ9NYB0 399 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 PSD3Q9NYI0 1048 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 MPP6Q9NZW5 540 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 UVRAGQ9P2Y5 699 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 SMC3Q9UQE7 1217 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 BTRCQ9Y297 605 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ETV7Q9Y603 341 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 CDH10Q9Y6N8 788 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 S4R3C0 116 aa-1.48□□□□□ -2.65
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