RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 CDS1Q92903 461 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 NPY6RQ99463 290 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CKAP5Q14008 2032 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PTGESO14684 152 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ADAMTS4O75173 837 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 NXPH3O95157 252 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 C8BP07358 591 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 GJA4P35212 333 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SYT13Q7L8C5 426 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 STON2Q8WXE9 905 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1W2PS29 197 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 BTBD17A6NE02 478 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 STAG3L3P0CL85 134 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MC2RQ01718 297 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CDONQ4KMG0 1287 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TRILQ7L0X0 811 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 NR4A3Q92570 626 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ARL6Q9H0F7 186 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 K7EQM0 130 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLITRK5O94991 958 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HLA-HP01893 362 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MTHFD2P13995 350 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MELKQ14680 651 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ASRGL1Q7L266 308 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 NATD1Q8N6N6 113 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SGTBQ96EQ0 304 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 INPP5KQ9BT40 448 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 POT1Q9NUX5 634 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 POLHQ9Y253 713 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 A0A087WUU8 490 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TUSC2O75896 110 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 UBL4AP11441 157 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 BMP4P12644 408 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 AREGP15514 252 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 FCER1GP30273 86 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 IRS1P35568 1242 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TAS2R38P59533 333 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TFF2Q03403 129 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 KCNC3Q14003 757 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 STEAP3Q658P3 488 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 COMMD7Q86VX2 200 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 GPR39O43194 453 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 RBBP9O75884 186 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SGSHP51688 502 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ACTBP60709 375 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ACTG1P63261 375 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 MZT1Q08AG7 82 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.356e-7■■■■□ 19.8
SPTA1-201ENST00000368147 Q1RN00 199 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 KIAA1191Q96A73 305 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TRIB1Q96RU8 372 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CUTCQ9NTM9 273 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 DMAC2Q9NW81 257 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 CACNA1GO43497 2377 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms