RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 KCNK1O00180 336 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BHLHE40O14503 412 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CHP2O43745 196 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR1F1O43749 312 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 B4GALT3O60512 393 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAD1O60671 282 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 YPEL1O60688 119 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TM7SF2O76062 418 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NADKO95544 446 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CPNE6O95741 557 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FGGP02679 453 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UMPSP11172 480 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PRKACAP17612 351 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MSH3P20585 1137 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GPD1P21695 349 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PCMT1P22061 227 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RPL9P32969 192 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TALDO1P37837 337 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC9A3P48764 834 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NXPH1P58417 271 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TPI1P60174 286 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAB10P61026 200 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DR1Q01658 176 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BIKQ13323 160 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GCKRQ14397 625 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GK3PQ14409 553 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PTGR1Q14914 329 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DNAL1Q4LDG9 190 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BEX5Q5H9J7 111 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RNLSQ5VYX0 342 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAD9BQ6WBX8 426 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CACUL1Q86Y37 369 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SFTPA2Q8IWL1 248 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KATNAL2Q8IYT4 538 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C4orf33Q8N1A6 199 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MARVELD2Q8N4S9 558 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZFP41Q8N8Y5 198 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR5AU1Q8NGC0 362 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR5D13Q8NGL4 314 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MITD1Q8WV92 249 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GUCD1Q96NT3 240 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TSSK2Q96PF2 358 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BPIFA3Q9BQP9 254 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SH2D3AQ9BRG2 576 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TEKT3Q9BXF9 490 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC2A11Q9BYW1 496 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 POTEKPQ9BYX7 375 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UBXN6Q9BZV1 441 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM9Q9C026 710 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 STRADBQ9C0K7 418 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO44Q9H4M3 255 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C5orf66Q9H5L9 145 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ACTR8Q9H981 624 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ETNK2Q9NVF9 386 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HIF1ANQ9NWT6 349 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 THYN1Q9P016 225 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR14J1Q9UGF5 321 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 POU2F3Q9UKI9 436 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CDH9Q9ULB4 789 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ERVK-11Q9UQG0 969 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HYKKA2RU49 373 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NPIPB6E9PJ23 425 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 F5H697 171 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TGOLN2O43493 480 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DCXO43602 365 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NIPSNAP2O75323 286 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SNAP29O95721 258 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PGK1P00558 417 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINB2P05120 415 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CT45A8P0DMV1 189 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CT45A9P0DMV2 189 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TFPIP10646 304 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HSD17B1P14061 328 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GP9P14770 177 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NCK1P16333 377 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ADORA1P30542 326 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RPL22P35268 128 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PTGFRP43088 359 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CRATP43155 626 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MAZP56270 477 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DEFA1P59665 94 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DEFA3P59666 94 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HERV-K104P61576 105 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MBTD1Q05BQ5 628 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CYP24A1Q07973 514 aa2.26□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TSNQ15631 228 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms