RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 CHTF18Q8WVB6 975 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 FOLH1BQ9HBA9 442 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVK13-1Q9NX77 482 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 HTR3BO95264 441 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SRFP11831 508 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PYCR3Q53H96 274 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CXorf36Q9H7Y0 433 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ASIC5Q9NY37 505 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 POLHQ9Y253 713 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 GLULP15104 373 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 BCL6P41182 706 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF81P51508 661 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SSR4P51571 173 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC2A12Q8TD20 617 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 GLIPR2Q9H4G4 154 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC6A20Q9NP91 592 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNN3Q9UGI6 736 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 DCDC2BA2VCK2 349 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TARM1B6A8C7 271 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ATG12O94817 140 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC2A5P22732 501 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SPARTQ8N0X7 666 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TREM1Q9NP99 234 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PRDM9Q9NQV7 894 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 MED17Q9NVC6 651 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 KCND3Q9UK17 655 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ASB4Q9Y574 426 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPAN9O75954 239 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM76BQ5HYJ3 339 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM217AQ8IXS0 508 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 IL21Q9HBE4 155 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL13Q9P2N7 655 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM202A6NGA9 273 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 MPIG6BO95866 241 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 AMY2AP04746 511 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS5P46782 204 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RBPJQ06330 500 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAAF1Q8NEP3 725 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SCGB1C1Q8TD33 95 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ASB17Q8WXJ9 295 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 WBP2Q969T9 261 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB9BQ9NP90 201 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 C17orf67Q0P5P2 114 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSM3Q53FZ2 586 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF691Q5VV52 312 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 OR7G1Q8NGA0 311 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5D14Q8NGL3 314 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5J2Q8NH18 312 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 MAB21L2Q9Y586 359 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RP2O75695 350 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PBX2P40425 430 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC26A5P58743 744 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RCBTB1Q8NDN9 531 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 LYRM4Q9HD34 91 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 BABAM2Q9NXR7 383 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ATG4BQ9Y4P1 393 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 K7ESM1 405 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 IFNGR1P15260 489 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 DNASE1P24855 282 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKAR1BP31321 381 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CCR5P51681 352 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 HSD17B7P56937 341 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 OR1J4Q8NGS1 313 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 FNDC8Q8TC99 324 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 POLE4Q9NR33 117 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1B0GX78 115 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM183AA6NL82 134 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms