RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 OR52L1Q8NGH7 329 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 C3orf49Q96BT1 292 aa16.4■□□□□ 0.22
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ACTB-201ENST00000331789 MGLLQ99685 303 aa16.4■□□□□ 0.22
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ACTB-201ENST00000331789 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa16.4■□□□□ 0.22
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ACTB-201ENST00000331789 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 OR51E2Q9H255 320 aa16.38■□□□□ 0.21
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ACTB-201ENST00000331789 MND1Q9BWT6 205 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 TAPBPLQ9BX59 468 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 MEN1O00255 615 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 CCL4P13236 92 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 LCN1P31025 176 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 ENTPD1P49961 510 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 SPHARQ15513 63 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-201ENST00000331789 SSX1Q16384 188 aa16.37■□□□□ 0.21
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