RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 LRRTM2O43300 516 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 MSL3P1P0C860 447 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ARL4DP49703 201 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 OR1D5P58170 312 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 FABP5Q01469 135 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL12Q53G59 568 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 PTP4A1Q93096 173 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 COQ7Q99807 217 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 HCAR1Q9BXC0 346 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 LANCL2Q9NS86 450 aa20.01■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 C12orf71A8MTZ7 269 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM150CB9EJG8 249 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ALAS2P22557 587 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 SLC6A6P31641 620 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 SDC2P34741 201 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 SLC9A3P48764 834 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 GPR143P51810 404 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 HSD11B2P80365 405 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 CDC20Q12834 499 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 CARFQ8N187 725 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC32Q9BV29 185 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 MMACHCQ9Y4U1 282 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF3P17036 446 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 HK1P19367 917 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 CELP19835 753 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 BCKDHBP21953 392 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 RPS7P62081 194 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 PSPHP78330 225 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 WDFY2Q96P53 400 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 NEURL2Q9BR09 285 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 MCCC2Q9HCC0 563 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 CPNE5Q9HCH3 593 aa20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 H3BMH7 237 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 PPP1R3DO95685 299 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 HLA-DPB1P04440 258 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 CLEC2LP0C7M8 214 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 PEPDP12955 493 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 NOS3P29474 1203 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 TGM4P49221 684 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 FCRLBQ6BAA4 426 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 MVB12AQ96EY5 273 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 OR1F2PQ96R84 312 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 TEAD3Q99594 435 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 OR51V1Q9H2C8 321 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 CMAHPQ9Y471 501 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 OR1D4P47884 311 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 BDH1Q02338 343 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 NDUFAF6Q330K2 333 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D25Q3MII6 688 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 KLBQ86Z14 1044 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 PLXDC1Q8IUK5 500 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF440Q8IYI8 595 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 GALNT6Q8NCL4 622 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ASB15Q8WXK1 588 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 DNASE2BQ8WZ79 361 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ALG8Q9BVK2 526 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 TMED9Q9BVK6 235 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D17Q9HA65 648 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 INPP5EQ9NRR6 644 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 TRAPPC4Q9Y296 219 aa19.99■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 SLC35F4A4IF30 521 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 GNB5O14775 395 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 DYRK3O43781 588 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 DUX1O43812 170 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 PTTG1O95997 202 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 IFNGP01579 166 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 IL9P15248 144 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 SLC16A1P53985 500 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 FHL1Q13642 323 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL26Q53HC5 615 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 MED25Q71SY5 747 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 LAX1Q8IWV1 398 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 CLIP3Q96DZ5 547 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 SGTBQ96EQ0 304 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 HOXD1Q9GZZ0 328 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ENAMQ9NRM1 1142 aa19.98■□□□□ 0.79
SPHK1-201ENST00000323374 ASB6Q9NWX5 421 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms