RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 MFSD12Q6NUT3 480 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 OR51L1Q8NGJ5 315 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 CXorf40AQ8TE69 158 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 RGS11O94810 467 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 KCT2Q8NC54 265 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 OR2L5Q8NG80 312 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 OR2T4Q8NH00 348 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 LGALS14Q8TCE9 139 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 OR8D1Q8WZ84 308 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 MOAP1Q96BY2 351 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 WBP1Q96G27 269 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 PTTG3PQ9NZH4 202 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 CALML5Q9NZT1 146 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 RCE1Q9Y256 329 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 RNF215Q9Y6U7 377 aa23.41■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 A0A1B0GVI7 797 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 TRIM77I1YAP6 450 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 PTHLHP12272 177 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 PTGS2P35354 604 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 MAGEB1P43366 347 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 TMEM239Q8WW34 195 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 SEC22CQ9BRL7 303 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 FN3KQ9H479 309 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 CMC2Q9NRP2 79 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 KCNE5Q9UJ90 142 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 A0A1W2PPL8 197 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 PEX12O00623 359 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 LYPD3O95274 346 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R3DO95685 299 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 P2RY2P41231 377 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 BTN3A2P78410 334 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 FAAP20Q6NZ36 180 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 OR56B4Q8NH76 319 aa23.4■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 ADH5P11766 374 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 ERVFC1P60507 584 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 TSPAN5P62079 268 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 OR1Q1Q15612 314 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 STPG1Q5TH74 334 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 HACD4Q5VWC8 232 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 SERPINA12Q8IW75 414 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 CMTM4Q8IZR5 234 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 OR14A2Q96R54 314 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 CA10Q9NS85 328 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 TMEM74BQ9NUR3 256 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa23.39■■□□□ 1.34
SENP3-201ENST00000321337 CARNS1A5YM72 827 aa23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 M0R233 179 aa23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 SAGP10523 405 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 LCN1P31025 176 aa23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 TCEA2Q15560 299 aa23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 TMEM52BQ4KMG9 183 aa23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 FGD2Q7Z6J4 655 aa23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 RDH8Q9NYR8 311 aa23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 NPTNQ9Y639 398 aa23.39■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 SLC22A31A6NKX4 558 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 ALDOBP05062 364 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 UGT2B7P16662 529 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 SLC2A5P22732 501 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 HOXD10P28358 340 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 RAB28P51157 221 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 MAP2K6P52564 334 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 NRG3P56975 720 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 ID2Q02363 134 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 TMIEQ8NEW7 156 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 C12orf10Q9HB07 376 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 COPZ2Q9P299 210 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 SIGLEC7Q9Y286 467 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 TFP02787 698 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 ADH1AP07327 375 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 NDUFS1P28331 727 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 TCTE1Q5JU00 501 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 RSPRY1Q96DX4 576 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SENP3-201ENST00000321337 LINC00052Q96N35 136 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms