RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 CXorf58Q96LI9 332 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC27-201ENST00000317907 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TTC27-201ENST00000317907 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC27-201ENST00000317907 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC27-201ENST00000317907 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC27-201ENST00000317907 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TTC27-201ENST00000317907 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TTC27-201ENST00000317907 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC27-201ENST00000317907 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.9□□□□□ -0.82
TTC27-201ENST00000317907 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.9□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 MEIKINA0A087WXM9 373 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 FAM183AA6NL82 134 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 FAM170BA6NMN3 283 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 FZD7O75084 574 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 UBXN7O94888 489 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 IGFBP4P22692 258 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 TPMTP51580 245 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 REEP5Q00765 189 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SLC9A5Q14940 896 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 OPCMLQ14982 345 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 GSG1Q2KHT4 349 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 DEFB134Q4QY38 66 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 OR2T4Q8NH00 348 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SFXN2Q96NB2 322 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 AMDHD1Q96NU7 426 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 A0A1W2PRQ8 180 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 OR2W5A6NFC9 320 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 PLATP00750 562 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 HPXP02790 462 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 KIAA1024LP59773 190 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 PPP1CAP62136 330 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 TCTE1Q5JU00 501 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 EOGTQ5NDL2 527 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SFXN4Q6P4A7 337 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 MOSPD2Q8NHP6 518 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 RFKQ969G6 155 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 BRD7Q9NPI1 651 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 NTNG1Q9Y2I2 539 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 L7N2F9 121 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 ERGP11308 486 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 GNSP15586 552 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 NDUFV2P19404 249 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 RFX3P48380 749 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SLC16A1P53985 500 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 TAS2R41P59536 307 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SLC3A1Q07837 685 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 AGERQ15109 404 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 VASNQ6EMK4 673 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 Q6ZS52 159 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 S1PR5Q9H228 398 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 OBP2AQ9NY56 170 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 CHST2Q9Y4C5 530 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 A0A0B4J203 849 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 A0A1W2PPK0 400 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC27-201ENST00000317907 RNF13O43567 381 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms