RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303731.8

TRAPPC1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC1, Length 811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-201ENST00000303731 HPCAP84074 193 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 CASP8Q14790 479 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 P2RY6Q15077 328 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SAXO2Q658L1 398 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SSX8Q7RTT4 187 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 NEURL3Q96EH8 262 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 POM121Q96HA1 1249 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 WDR45Q9Y484 360 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 INHBBP09529 407 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ENPP1P22413 925 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 IL32P24001 234 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 S100A3P33764 101 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 HHATQ5VTY9 493 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ANKRD46Q86W74 232 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 HSD17B8Q92506 261 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 CCDC115Q96NT0 180 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 GSX2Q9BZM3 304 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ACER3Q9NUN7 267 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 KCNE5Q9UJ90 142 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF724A8MTY0 619 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 CYTIPO60759 359 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 CYP7B1O75881 506 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 OR12D1P0DN82 309 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 PAX1P15863 534 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 PGM1P36871 562 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 SESN3P58005 492 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 BST1Q10588 318 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 MERTKQ12866 999 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ITGADQ13349 1161 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 Q6ZT83 130 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 CMIPQ8IY22 773 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF611Q8N823 705 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 PMM1Q92871 262 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 S100PBPQ96BU1 408 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ROPN1LQ96C74 230 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 OR5B2Q96R09 309 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 PSD2Q9BQI7 771 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 BDH2Q9BUT1 245 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 LIPT1Q9Y234 373 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 HS3ST1O14792 307 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 DNPH1O43598 174 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 MAGEA8P43361 318 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 OR3A2P47893 321 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 PHC1P78364 1004 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 MPP2Q14168 576 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 SYT14P1Q58G82 188 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF563Q8TA94 476 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC1-201ENST00000303731 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms