RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 BMXP51813 675 aa8.77□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 ACTBL2Q562R1 376 aa8.77□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 NAA40Q86UY6 237 aa8.77□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 SULF2Q8IWU5 870 aa8.77□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.77□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 SLC23A2Q9UGH3 650 aa8.77□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa8.77□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 AKR1C1Q04828 323 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ZNF75AQ96N20 296 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 TFP02787 698 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 IDUAP35475 653 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 HES5Q5TA89 166 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 BADQ92934 168 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 NUDT9Q9BW91 350 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 OIP5O43482 229 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 HSD17B1P14061 328 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 WNT4P56705 351 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CATR1Q13166 79 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 C14orf28Q4W4Y0 310 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 COMMD7Q86VX2 200 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 OR2T27Q8NH04 317 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 RETP07949 1114 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SSR4P51571 173 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CST9LP1Q5W188 147 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 TMEM135Q86UB9 458 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SAMD8Q96LT4 415 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 LGALS4P56470 323 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 PDE7AQ13946 482 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SLC36A2Q495M3 483 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SERPINA11Q86U17 422 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 PEBP4Q96S96 227 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 EHFQ9NZC4 300 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 GPR52Q9Y2T5 361 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 PSAT1Q9Y617 370 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 RAB5CP51148 216 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 FAM180BQ6P0A1 224 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 NOXA1Q86UR1 476 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 PPA2Q9H2U2 334 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 POLHQ9Y253 713 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 FEZF1A0PJY2 475 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SURF4O15260 269 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 GJB5O95377 273 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 HOXC13P31276 330 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 GSK3AP49840 483 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ULBP3Q9BZM4 244 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CBLCQ9ULV8 474 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CERS1P27544 350 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 IL10RAQ13651 578 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 LTB4RQ15722 352 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 STK11Q15831 433 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 POT1Q9NUX5 634 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CHRNB1P11230 501 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ELP2Q6IA86 826 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SVBPQ8N300 66 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 FNDC8Q8TC99 324 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 RNF170Q96K19 258 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 PRRC1Q96M27 445 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 MFFQ9GZY8 342 aa8.77□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 LRRC30A6NM36 301 aa8.76□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 C4orf47A7E2U8 309 aa8.76□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.76□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ZNF44P15621 663 aa8.76□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 CXCL12P48061 93 aa8.76□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 MPPED2Q15777 294 aa8.76□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.76□□□□□ -1.01
CUX1-201ENST00000292535 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms