RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 DPH1Q9BZG8 443 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 AMBNQ9NP70 447 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SOCS6O14544 535 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 WISP1O95388 367 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NBL1P41271 181 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CTBP2P56545 445 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NRG3P56975 720 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 BROXQ5VW32 411 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFB124Q8NES8 71 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 OR11G2Q8NGC1 345 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5M3Q8NGP4 307 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CT55Q8WUE5 264 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NODALQ96S42 347 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ENKD1Q9H0I2 346 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087WUJ7 227 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 MASP2O00187 686 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFAND5O76080 213 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 IFI30P13284 250 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TCN2P20062 427 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 STAT5AP42229 794 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NUDT6P53370 316 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PSPHP78330 225 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 BTBD16Q32M84 506 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 MRGPREQ86SM8 312 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 HGDQ93099 445 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 BPIFA2Q96DR5 249 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 LAT2Q9GZY6 243 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TCFL5Q9UL49 500 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 MED31Q9Y3C7 131 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SPTBN2O15020 2390 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PQ72 361 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 GNB5O14775 395 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFB5O43674 189 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKYO43930 277 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2J2O76002 312 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 FOLR3P41439 243 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 RBM34P42696 430 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TEKQ02763 1124 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 MVKQ03426 396 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PMS2P3Q13401 168 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 FHL1Q13642 323 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF138Q8WVD3 245 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 HS6ST2Q96MM7 605 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 HCRTR2O43614 444 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PCMT1P22061 227 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CCR4P51679 360 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SCO2O43819 266 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 GMFGO60234 142 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 MAN1A2O60476 641 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM20BO75063 409 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 F8A1P23610 371 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 COPZ1P61923 177 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms