RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 ACER3Q9NUN7 267 aa20.61■□□□□ 0.89
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SIGMAR1-201ENST00000277010 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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SIGMAR1-201ENST00000277010 PRRG2O14669 202 aa20.6■□□□□ 0.89
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SIGMAR1-201ENST00000277010 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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SIGMAR1-201ENST00000277010 J3QKU1 62 aa20.58■□□□□ 0.88
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SIGMAR1-201ENST00000277010 STSP08842 583 aa20.58■□□□□ 0.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF708P17019 499 aa20.58■□□□□ 0.88
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SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 C1QL3Q5VWW1 255 aa20.58■□□□□ 0.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.58■□□□□ 0.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZGRF1Q86YA3 2104 aa20.58■□□□□ 0.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa20.58■□□□□ 0.88
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SIGMAR1-201ENST00000277010 ME2P23368 584 aa20.57■□□□□ 0.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 ELK4P28324 431 aa20.57■□□□□ 0.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 TACR3P29371 465 aa20.57■□□□□ 0.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR1E2P47887 323 aa20.57■□□□□ 0.88
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SIGMAR1-201ENST00000277010 OR52E4Q8NGH9 312 aa20.57■□□□□ 0.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 GORASP2Q9H8Y8 452 aa20.57■□□□□ 0.88
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SIGMAR1-201ENST00000277010 SFTPDP35247 375 aa20.56■□□□□ 0.88
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