RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 IHHQ14623 411 aa15.95■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA0040Q15053 153 aa15.95■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF765Q7L2R6 523 aa15.95■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.95■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.95■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 EMC7Q9NPA0 242 aa15.95■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM129A0AVI4 362 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM64A6NGJ6 449 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SLC6A12P48065 614 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 BTG1P62324 171 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 POU4F2Q12837 409 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ENPP2Q13822 863 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 BCL2A1Q16548 175 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF385BQ569K4 471 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 LCTLQ6UWM7 567 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SIAH3Q8IW03 269 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PDE7BQ9NP56 450 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 OBP2AQ9NY56 170 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SBF1O95248 1867 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RNF13O43567 381 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TNFRSF4P43489 277 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CHRNEQ04844 493 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 FAM69AQ5T7M9 428 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 HACD4Q5VWC8 232 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 FIGNL1Q6PIW4 674 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TTLL10Q6ZVT0 673 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 APH1BQ8WW43 257 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 THAP4Q8WY91 577 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PEX11GQ96HA9 241 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PRR14Q9BWN1 585 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 HDAC8Q9BY41 377 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SYNPO2LQ9H987 977 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 NOX3Q9HBY0 568 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 NAP1L6A6NFF2 107 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 LAMTOR5O43504 91 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SC5DO75845 299 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PPP1R3DO95685 299 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GDI2P50395 445 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 NFATC4Q14934 902 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 P2RY14Q15391 338 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RPE65Q16518 533 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 VRK2Q86Y07 508 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RASGRP3Q8IV61 690 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TCTE3Q8IZS6 198 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GATSQ8NAP1 163 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ELSPBP1Q96BH3 223 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PDXPQ96GD0 296 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 C5orf34Q96MH7 638 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 AIFM2Q9BRQ8 373 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GLS2Q9UI32 602 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 LAMP5Q9UJQ1 280 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RLN2P04090 185 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SRP9P49458 86 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 EVX1P49640 407 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 HYAL1Q12794 435 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TDGQ13569 410 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GAS6Q14393 721 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TCTE1Q5JU00 501 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SLC25A24Q6NUK1 477 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TPRA1Q86W33 373 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 AVL9Q8NBF6 648 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 OR5K2Q8NHB8 316 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 NEURL3Q96EH8 262 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 MED20Q9H944 212 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ACTR10Q9NZ32 417 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 UTRNP46939 3433 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 MAS1P04201 325 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ELK1P19419 428 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 DLX5P56178 289 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PM20D2Q8IYS1 436 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 OR6N2Q8NGY6 317 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SMPDL3BQ92485 455 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 C1GALT1Q9NS00 363 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms