RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 MLC1Q15049 377 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 BMPERQ8N8U9 685 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CHST8Q9H2A9 424 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 MALT1Q9UDY8 824 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ACSL6Q9UKU0 697 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PADI2Q9Y2J8 665 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GX78 115 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 FGF17O60258 216 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CCKBRP32239 447 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CCT3P49368 545 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ID2Q02363 134 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ZMYND11Q15326 602 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RGNQ15493 299 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf189Q5VU69 101 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OR51Q1Q8NH59 317 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OR5AK3PQ8NH89 298 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 NEUROD4Q9HD90 331 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 MGAT4AQ9UM21 535 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SRPK3Q9UPE1 567 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ORC5O43913 435 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 TP53P04637 393 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PRKAR1AP10644 381 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SOAT1P35610 550 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CDH12P55289 794 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CYP27C1Q4G0S4 372 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 DDI2Q5TDH0 399 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PLAG1Q6DJT9 500 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC116Q8IYX3 515 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OR4K14Q8NGD5 310 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A46Q96AG3 418 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SLC35A5Q9BS91 424 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PPA2Q9H2U2 334 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SEC14L4Q9UDX3 406 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 DPM1O60762 260 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 POU2F1P14859 743 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CLDN20P56880 219 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 E2F1Q01094 437 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RHBDD2Q6NTF9 364 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 STUB1Q9UNE7 303 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SSR3Q9UNL2 185 aa18.79■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PCDH17O14917 1159 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PLOD3O60568 738 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SCRG1O75711 98 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CCL4P13236 92 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 XCR1P46094 333 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 XKP51811 444 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SPIBQ01892 262 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 BTN1A1Q13410 526 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ERV3-1Q14264 604 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 HDDC2Q7Z4H3 204 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R3BQ86XI6 285 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 Q8N402 240 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SLC38A9Q8NBW4 561 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 DUSP18Q8NEJ0 188 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CLEC2DQ9UHP7 191 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PROB1E7EW31 1015 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 LYRM1O43325 122 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CRATP43155 626 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SELENOWP63302 87 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 DSG2Q14126 1118 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 LGI4Q8N135 537 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OR9Q2Q8NGE9 314 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RIT1Q92963 219 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ING4Q9UNL4 249 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 KIF26BQ2KJY2 2108 aa18.78■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMDEC1O15204 470 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CCNB2O95067 398 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RAF1P04049 648 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 FGF5P12034 268 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 MPIP34949 423 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ETV1P50549 477 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM81Q6P7N7 255 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OR9A2Q8NGT5 310 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OR10Z1Q8NGY1 313 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 FBXW5Q969U6 566 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF304Q9HCX3 659 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 POFUT2Q9Y2G5 429 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 B4GALT2O60909 372 aa18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms