RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 SLC48A1Q6P1K1 146 aa16.44■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 C7orf34Q96L11 122 aa16.44■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 AIFM2Q9BRQ8 373 aa16.44■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 IKZF5Q9H5V7 419 aa16.44■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 LMAN1LQ9HAT1 526 aa16.44■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa16.44■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 A0A1B0GTW7 788 aa16.44■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 UGT2B7P16662 529 aa16.44■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 PRKAR1BP31321 381 aa16.44■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 GPR139Q6DWJ6 353 aa16.44■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 INIPQ9NRY2 104 aa16.44■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 TCRBV5S2A0A599 114 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 RAD1O60671 282 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 SYNGR4O95473 234 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 MAOBP27338 520 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 LTB4RQ15722 352 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 METRNLQ641Q3 311 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 LIMS2Q7Z4I7 341 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 PDXPQ96GD0 296 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 SLC5A7Q9GZV3 580 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 SLC6A5Q9Y345 797 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 SNX11Q9Y5W9 270 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 SC5DO75845 299 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 RAB3DO95716 219 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 HBQ1P09105 142 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 HACD4Q5VWC8 232 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 LAX1Q8IWV1 398 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 H3BQ06 376 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 ARL6IP1Q15041 203 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 NXNL2Q5VZ03 156 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 ELP4Q96EB1 424 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 C19orf43Q9BQ61 176 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 TM7SF3Q9NS93 570 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 KCNN3Q9UGI6 736 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 BLACEA4D250 179 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 METTL15A6NJ78 407 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 H3BML4 177 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 H7C417 338 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 TFP02787 698 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 FOXB2Q5VYV0 432 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 B3GLCTQ6Y288 498 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF595Q8IYB9 648 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 TMEFF1Q8IYR6 380 aa16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 M0R036 132 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 CD34P28906 385 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 POU3F4P49335 361 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 RAB38P57729 211 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM150AQ86TG1 271 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 PDZD9Q8IXQ8 264 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 STRADBQ9C0K7 418 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 DUSP21Q9H596 190 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 RLIMQ9NVW2 624 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 CACNA1CQ13936 2221 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 A0A0G2JMP0 313 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 CPNE6O95741 557 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 AKR1C4P17516 323 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 GIFP27352 417 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 TNFRSF4P43489 277 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 EMP2P54851 167 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 OR4M2Q8NGB6 313 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 ELMOD3Q96FG2 381 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 CRB3Q9BUF7 120 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 H7C2Y5 167 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 SLC22A5O76082 557 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 PLATP00750 562 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 RPS5P46782 204 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 CBFBQ13951 182 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF77Q15935 545 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 AWAT2Q6E213 333 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 COQ10AQ96MF6 247 aa16.42■□□□□ 0.22
SCARB2-201ENST00000264896 ANKRD19PQ9H560 264 aa16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms