RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 ENTPD6O75354 484 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PTHP01270 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 HMGN1P05114 100 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TNNI3P19429 210 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FASLGP48023 281 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PCYT1AP49585 367 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RORCP51449 518 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 LIM2P55344 173 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R41P59536 307 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 HHEXQ03014 270 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ST3GAL3Q11203 375 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB40BQ12829 278 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CBX3Q13185 183 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SPHARQ15513 63 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SNAPC1Q16533 368 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FJX1Q86VR8 437 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 POC5Q8NA72 575 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 NUP43Q8NFH3 380 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 THAP4Q8WY91 577 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PMM1Q92871 262 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OSTF1Q92882 214 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB8BQ92930 207 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TGM7Q96PF1 710 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 COQ7Q99807 217 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MED17Q9NVC6 651 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PADI1Q9ULC6 663 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ISM1B1AKI9 464 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 C21orf140B9A014 251 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK2AP1O14519 115 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PRODHO43272 600 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CHST10O43529 356 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA0513O60268 411 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CEACAM4O75871 244 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5F1O95221 314 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 AK1P00568 194 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 IFI6P09912 130 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN19P0C672 248 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 COX6B1P14854 86 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TYRP1P17643 537 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ALOX12P18054 663 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMB5P28074 263 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKAR1BP31321 381 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PTGER4P35408 488 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 BCL6P41182 706 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CAPZA2P47755 286 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKAG1P54619 331 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF91Q05481 1191 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN31Q12999 210 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 GINS1Q14691 196 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RPE65Q16518 533 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SYPL1Q16563 259 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.49□□□□□ -1.37
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