RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262067.4

TSPAN13-201, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN13, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-201ENST00000262067 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 IRGMA1A4Y4 181 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 FAM183AA6NL82 134 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 SCDO00767 359 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 HCN1O60741 890 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 SOX3P41225 446 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 COPZ1P61923 177 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 DCAF7P61962 342 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 NXNL2Q5VZ03 156 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 ADCK1Q86TW2 530 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 OAFQ86UD1 273 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF440Q8IYI8 595 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 SH3GL3Q99963 347 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 IFT27Q9BW83 186 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 SOCS6O14544 535 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 REM1O75628 298 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 MYL12AP19105 171 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 FHL1Q13642 323 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM44Q2T9K0 475 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC15A4Q8N697 577 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 IFI44Q8TCB0 444 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 WWTR1Q9GZV5 400 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 COPS7AQ9UBW8 275 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 RARRES3Q9UL19 164 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 A0A087WUJ7 227 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 SCRG1O75711 98 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 UBL4AP11441 157 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 OPRL1P41146 370 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 GPR143P51810 404 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 SKP2Q13309 424 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 PLBD1Q6P4A8 553 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 CBLN3Q6UW01 205 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 OIT3Q8WWZ8 545 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 OTULINQ96BN8 352 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 C3orf49Q96BT1 292 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 RACGAP1Q9H0H5 632 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TSPAN13-201ENST00000262067 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ICOSLGO75144 302 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 HTR1FP30939 366 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TUBA1BP68363 451 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 FOXK2Q01167 660 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 C1DQ13901 141 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 USP43Q70EL4 1123 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TUBA1AQ71U36 451 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 OR4F15Q8NGB8 312 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 VMP1Q96GC9 406 aa22.02■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TECTAO75443 2155 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SERPINB10P48595 397 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 MESP1Q9BRJ9 268 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 MED20Q9H944 212 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 MCCC2Q9HCC0 563 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ICAM5Q9UMF0 924 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 OR2G6Q5TZ20 316 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC29A4Q7RTT9 530 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 CEP76Q8TAP6 659 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 RTN4RQ9BZR6 473 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TO15178 435 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF264O43296 627 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 GPX5O75715 221 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 LIMS3P0CW19 117 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 LIMS4P0CW20 117 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 IL12BP29460 328 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 HOXD12P35452 270 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 CCR4P51679 360 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 DAB2P98082 770 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ANKDD1AQ495B1 522 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 FCRLBQ6BAA4 426 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 RTL4Q6ZR62 310 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 BORCS5Q969J3 196 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 NACC2Q96BF6 587 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SGTBQ96EQ0 304 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 HCAR1Q9BXC0 346 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 FN3KQ9H479 309 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 APMAPQ9HDC9 416 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 CMC2Q9NRP2 79 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM129A0AVI4 362 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 WWP2O00308 870 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TSPAN2O60636 221 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms