RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261947.4

RNF130-201, Transcript of ring finger protein 130, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF130, Length 1,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF130-201ENST00000261947 A0A0G2JMM0 328 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 A0A1W2PPB8 328 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 A0A1W2PRS3 328 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 KIR3DP1A8MWS1 328 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 TAF4O00268 1085 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 SNPHO15079 494 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 CHP2O43745 196 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 SLC1A3P43003 542 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 KCNAB2Q13303 367 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 SEC23BQ15437 767 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 PODNL1Q6PEZ8 512 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 CATSPER1Q8NEC5 780 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 GIPC3Q8TF64 312 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 SLC38A4Q969I6 547 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 C3orf49Q96BT1 292 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 TAS2R10Q9NYW0 307 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 GPR85P60893 370 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 QPRTQ15274 297 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 PPP4R4Q6NUP7 873 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 OR4K17Q8NGC6 315 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 OR1J4Q8NGS1 313 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 HES7Q9BYE0 225 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 VCX3BQ9H321 246 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 SELENONQ9NZV5 590 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 PRDM4Q9UKN5 801 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 A0A087WUU8 490 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 A0A087WV48 116 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 SH3PXD2BA1X283 911 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 EI24O14681 340 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 PEX1O43933 1283 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 CCNB2O95067 398 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 RASAL1O95294 804 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 NTN1O95631 604 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 TIGD3Q6B0B8 471 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 WDR88Q6ZMY6 472 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.578e-8■■■■□ 26.2
RNF130-201ENST00000261947 PTGES2Q9H7Z7 377 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 SP1P08047 785 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 ARSKQ6UWY0 536 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 GALNT4Q8N4A0 578 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 OR10G2Q8NGC3 310 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 TMEM255BQ8WV15 326 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 MPP4Q96JB8 637 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 GNRHR2Q96P88 292 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 ADAM19Q9H013 955 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 GP1BBP13224 206 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 ANKRD34AQ69YU3 496 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 SLC25A25Q6KCM7 469 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 BORAQ6PGQ7 559 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 OR9Q2Q8NGE9 314 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 TMEM234Q8WY98 164 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 ZNF597Q96LX8 424 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 SMURF2Q9HAU4 748 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 KLHL1Q9NR64 748 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 VDAC3Q9Y277 283 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 MGAQ8IWI9 3026 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 CHD8Q9HCK8 2581 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 CD46P15529 392 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 TACR3P29371 465 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 LINC00114Q6XXX2 140 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 ZNF730Q6ZMV8 503 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 OR4K5Q8NGD3 323 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 ST8SIA1Q92185 356 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 FAM173AQ9BQD7 235 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 OSBPL10Q9BXB5 764 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 MED17Q9NVC6 651 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF130-201ENST00000261947 TNFSF10P50591 281 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 PPP2R2BQ00005 443 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 DAG1Q14118 895 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 SULF2Q8IWU5 870 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 PACRGLQ8N7B6 248 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 OR2M7Q8NG81 312 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 C5orf34Q96MH7 638 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 FEVQ99581 238 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 VCXQ9H320 206 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 C8orf4Q9NR00 106 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 CSAG2Q9Y5P2 127 aa24.82■■□□□ 1.56
RNF130-201ENST00000261947 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms