RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
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SRSF1-201ENST00000258962 OMA1Q96E52 524 aa15.98■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ABHD17AQ96GS6 310 aa15.98■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 APOL4Q9BPW4 351 aa15.98■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.98■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa15.98■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 AASSQ9UDR5 926 aa15.98■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa15.98■□□□□ 0.15
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SRSF1-201ENST00000258962 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 GATSQ8NAP1 163 aa15.97■□□□□ 0.15
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF527Q8NB42 609 aa15.97■□□□□ 0.15
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SRSF1-201ENST00000258962 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa15.97■□□□□ 0.15
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SRSF1-201ENST00000258962 A6NL46 340 aa15.96■□□□□ 0.15
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SRSF1-201ENST00000258962 IL12BP29460 328 aa15.96■□□□□ 0.15
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SRSF1-201ENST00000258962 ENTHD1Q8IYW4 607 aa15.96■□□□□ 0.15
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SRSF1-201ENST00000258962 TMEM236Q5W0B7 351 aa15.95■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 NRMQ8IXM6 262 aa15.95■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 LSMEM1Q8N8F7 131 aa15.95■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.95■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 OR11G2Q8NGC1 345 aa15.95■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 OR8K3Q8NH51 312 aa15.95■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 PIGXQ8TBF5 258 aa15.95■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 FAM81AQ8TBF8 368 aa15.95■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 GRHL3Q8TE85 626 aa15.95■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 APH1BQ8WW43 257 aa15.95■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
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SRSF1-201ENST00000258962 IFNGR2P38484 337 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 NFATC3Q12968 1075 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 KIF18BQ86Y91 864 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF440Q8IYI8 595 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF566Q969W8 418 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF700Q9H0M5 742 aa15.94■□□□□ 0.14
SRSF1-201ENST00000258962 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.94■□□□□ 0.14
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